Le GEIE GECOTTI-PE est statutairement composé de deux membres fondateurs : la Région Hauts-de-France (France) et la Région Wallonne (Belgique).
Ces membres apportent leurs expériences dans la gestion de Programmes européens et donnent leurs avis et directives quant aux orientations à apporter.
La Région Hauts-de-France a été désignée, après appels à candidatures de la Commission européenne, « Autorité de Gestion » des Programmes et « Entité mandatée » de l’Initiative actuellement hébergés au sein du GEIE GECOTTI-PE.